浪潮TS10000高性能计算集群,由1个管理节点、1个用户登录节点、2288TB磁盘存储以及81个计算节点组成,计算节点共计1156个颗CPU核心,具体配置如下:
管理节点:用于系统管理,普通用户无权登录。
节点名 CPU型号与主频 核数 内存 硬盘 数量 mu01 2*Intel Xeon E5-2620 v3(2.4GHz) 12 32GB 300GB 1 用户登录节点:用于用户登录、编译以及通过作业调度系统提交管理作业等;
节点名
CPU型号与主频
核数
内存
硬盘
数量
mu01
2*Intel Xeon E5-2620 v3(2.4GHz)
12
32GB
300GB
1
禁止用户在此节点上不通过作业调度系统直接运行作业。
mu02
刀片计算节点:74个
c0101-c0142,
c0301-c0332
2*Intel Xeon X5650(2.67GHz)
24GB
150GB
74
胖节点:6个
fat01、fat02、fat03
4*Intel Xeon E7-4820 v3(1.90GHz)
40
1T
900GB
3
fat04、05
4*Intel Xeon Gold 5118(2.30GHz)
48
2
c0401
4*Intel Xeon X7560 (2.27GHz)
32
125GB
GPU计算节点:1个
GPU
gpu01
2*NVIDIA Tesla K40m GPU卡
2*Intel Xeon E5-2650 v3(2.30GHz) 20核
200GB
管理网络:通过千兆以太网互联
计算网络:通过40Gb QDR高速InfiniBand网络实现,旧IB网络采用20Gbps DDR实现,新旧交换机采用两根线缆连通。
存储系统:Lustre并行文件系统
操作系统:CentOS Linux release 7.2.1511
编译器:Intel、PGI和GCC等C/C++、Fortran编译器
作业调度:浪潮TSCE作业调度系统
并行环境:Intel MPI和Open MPI等,支持MPI并行程序;
应用软件:目前已安装短序列比对软件Bowtie、序列拼接软件velvet、Trinity等生物信息软件。
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